A Parse Biosciences, uma empresa da QIAGEN, e a especialista em proteômica Nomic Bio anunciaram uma parceria para criar o Cascade, um conjunto de dados fundamental desenvolvido para ajudar pesquisadores a modelar a resposta imunológica humana e identificar potenciais alvos de medicamentos.
O projeto combinará medições de célula única e em nível proteico coletadas em vários momentos. Está previsto que inclua 100 milhões de perfis de RNA-seq de célula única e mais de 11.000 perfis proteômicos de secretoma, abrangendo respostas de células imunes a mais de 150.000 condições individuais e combinadas de perturbação por citocinas e medicamentos.
Ao combinar dados transcriptômicos e proteômicos das mesmas respostas imunológicas, o Cascade pretende fornecer informações sobre os mecanismos por trás da sinalização imunológica humana. As empresas afirmam que isso poderia ajudar a resolver a escassez de dados para o desenvolvimento de modelos preditivos de células virtuais e melhorar a capacidade dos pesquisadores farmacêuticos de identificar e validar alvos terapêuticos.
O conjunto de dados recebeu compromissos iniciais da GSK, Pfizer, Sanofi, Graph Therapeutics e Turbine. A Parse gerará os dados de RNA-seq de célula única em seu GigaLab, uma instalação de alto rendimento capaz de analisar bilhões de células anualmente. A Nomic produzirá as medições proteômicas do secretoma usando sua plataforma Omini 1000, que mede mais de 1.000 proteínas secretadas nas amostras.
Charlie Roco, cofundador e diretor de tecnologia da Parse Biosciences, afirmou que o desenvolvimento de IA biológica é limitado pela escassez de dados sobre as respostas imunológicas humanas a perturbações importantes, incluindo citocinas e medicamentos. Ele descreveu o Cascade como um passo para revelar essas interações e aumentar a capacidade preditiva dos modelos de IA dos parceiros.